Fue construida en 1610. Acogió la imagen de la Virgen María de la Jonquera hasta su posterior traslado a la iglesia parroquial. Fue entonces cuando la capilla pasó a dar culto a san Miguel Arcángel y desde entonces presidió la ermita el retablo gótico de san Miguel, obra de Bernat Martorell, cuyo retablo estuvo ahí hasta que a principios del siglo XX fue trasladado a Tarragona para su restauración y actualmente se encuentra en la Catedral de Tarragona. Actualmente en la ermita de San Miguel se puede ver una reproducción hecha por el pintor Salvador Jané.